لم يمهله القدر كثيرا مع غضب شعبي متصاعد، حيث أعلن الفريق أول عوض بن عوف وزير الدفاع ونائب الرئيس السوداني عمر البشير، اعتقال الأخير والتحفظ عليه في مكان آمن
