كانت أولى الأزمات بعد 4 سنوات من التأسيس فيما عرف بـ"انشقاق الإسماعيلية" بينما كانت شرارتها المؤثرة مع إعفاء أحمد السكري وكيل الجماعة عام 1947، وصولا إلى أكتوبر/ تشرين الأول 2021، الذي شهد تبادلا في العزل والفصل بين قيادات عليا بها..
